宮崎です。
数日間いろいろ調査した結果、リンカーエラーの原因は
clapack 側の問題ではなく、gcc の問題だとわかりました。
細かい理由はよくわかりませんが、とりあえず下のような
Makefile でリンクが通って、実行ファイルができました。
GCC := /usr/local/bin/gcc-3.3.2
CFLAGS := -Wall
LDFLAGS := --verbose -V
PATH_LAPACK := /usr/local/lib/clapack
PATH_ATLAS := /usr/local/lib/atlas/Linux_PIIISSE1
LIB := -llapack -lcblaswr -lcblas -latlas -lF77 -lI77 -lm
LDFLAGS := -L$(PATH_ATLAS) -L$(PATH_LAPACK) $(LIB)
LINKER := /usr/local/bin/ld
LINKER_EMULATION := -m elf_i386
LINKER_DYNAMIC-LINK := -dynamic-link /lib/ld-linux.so.2
LINKER_PRE := /usr/lib/crt1.o /usr/lib/crti.o
/usr/local/lib/gcc-lib/i686-pc-linux-gnu/3.3.2/crtbegin.o
LINKER_LIBRARIES_C_GCC := -lc /usr/lib/libc.so
/usr/local/lib/gcc-lib/i686-pc-linux-gnu/3.3.2/libgcc.a
LINKER_POST :=
/usr/local/lib/gcc-lib/i686-pc-linux-gnu/3.3.2/crtend.o
/usr/lib/crtn.o
SOURCE := test1.c
OBJ := test1.o
PROG := test1
all: debug
debug : $(SOURCE)
$(GCC) -DDEBUG -g -c $(SOURCE) $(CFLAGS)
$(LINKER) -o $(PROG) $(LDFLAGS) $(LINKER_EMULATION)
$(LINKER_DYNAMIC-LINK) $(LINKER_PRE) $(OBJ) $(LDFLAGS)
-lefence $(LINKER_LIBRARIES_C_GCC) $(LINKER_POST)
rm -f $(OBJ)
お騒がせしました。