[vine-users:079295] athlon 64 X2 環境でシステムクロックが 異常に進んでしまう

["hamabo" <hamabo@xxxxxxxxxxxxxxx>]

初めて投稿させて頂きます。

件名にあるとおり、現在システムクロックが1分間に約56秒ずつ進んでしまっています。 

その結果、システムクロックに依存したプログラム等がエラーを起こしたりして困っております。

現在の環境は以下の通りです。
ハード
CPU: AMD Athlon X2 4450e　(CnQ on)
M/B: Gigabyte GA-MA78G-DS3H rev2.0 Bios FB
M/M: Sanmax/Micron DDR2 2G×2
HDD: HGST HDS721680PLA380×2 AHCI
VGA: onBoard
PWR: Antec EA-380

OS Vine 4.2 kernel2.6.16-76.47vl4

NTPサーバでは
ntp1.jst.mfeed. 210.173.160.86   2 u  242 1024  377   40.090  -36625. 
30037.0
ntp-tk01.ocn.ad 202.234.233.105  3 u  724 1024  372   48.191  -37014. 
3977.94
ntp-tk02.ocn.ad 202.234.233.104  3 u  380 1024  377   55.858  -25864. 
27436.0
ntp-os01.ocn.ad 202.234.233.104  3 u  239 1024  377   62.444  -38127. 
30038.4
と大幅に進んでいく一方なので、ハードウェアクロックをcronで1分毎に読み込んでいます。（ハードウェアクロックは狂わない）
NTPサーバは一向に自動で同期してくれませんので、cronで10分毎にntpdateさせています。

しかし、根本的に解決せず、また1分毎に56秒戻されますので、ログ時系列が凄い事になりますし、何よりタイムスタンプにもずれが出ます。

現行機はIntel CoreDuoで、CPUとマザーボード以外全く同じハードウェア構成、ソフトウェアも同じ設定ですが、こちらは全く正常にNTPサーバが同期、システムクロックもコンマ以下のずれで補正されています。

CnQが悪さしてるのかとも思い、BiosでCnQをOffにしましたが変わらず。
また、クロックも×5で1Ghzに固定しましたが、これも変わらず。
他に、Bios更新、CMOSクリア、電池交換、ブートオプションでnotsc、ファイアウォールもUDP123は開いています。勿論NTPサーバは起動しています。

ウェブ上ではkernel2.6.14以降で直っている、とありましたが、2.6.16でこの現象が起こっています。
このままでは流石に連続稼動させる事ができませんので、アドバイスありましたら、どうぞ宜しくお願い致します。